梅里埃VITEK梅里埃鉴定卡是一种包含多个检测区域,同时进行多个生化反应的特殊培养基鉴定系统,它可以用来鉴定肠杆菌科,葡萄球菌,李斯特菌,链球菌,厌氧菌,革兰氏阴性菌和氧化酶阳性菌等。通过在各检测区域生化反应后不同的颜色变化组合,对照测试编码手册,来鉴定微生物的种类。
DNA测序进行菌种鉴定的结果比传统生化鉴定更为直接,鉴定结果也更为可靠。测序不依赖菌种本身特点,对所有菌种均可使用。对于细菌,对16SrRNA进行分析鉴定,对于真菌,对其ITS基因进行测序分析。
利用特定引物PCR扩增未知菌株的16SrRNA基因或者ITS区,并进行DNA测序,与GenBank中的已知序列进行同源性比较后,判定细菌种类,将细菌划分到属或种。
微基生物专注微生物多样性研究,为高校、医院、研究所等单位提供科研服务。不仅可以检测土壤、水体、粪便、肠道内容物等样本中混合微生物的种类及丰度,而且还可以提供细菌、真菌等纯菌的菌种鉴定服务。
土壤、水体、粪便等样本中的微生物一般为混合菌,需要在一定条件下通过培养、分离、纯化后,得到纯菌。对纯的细菌、真菌等菌种,均可进行菌种鉴定服务。
菌种鉴定一般是提取纯菌A的基因组DNA,然后PCR扩增16srDNA片段,之后通过一代测序或三代测序检测16SrDNA的全长,与国际上的数据库进行Blast比对,默认选取比对结果中相似性高的前位的物种分类信息,之后构建系统发育树,得出样本A与XX物种的相似性高。